几分钟超神,直接用PubMed来分析文献研究趋势(上)

文章来源 :

2019-06-25 17:41

发布者 :

 如果没有GoPubMed或者PubMed PubReMiner之类的工具,要么来分析近期的研究趋势呢?当然,如果你不知道GoPubMed或者PubMed PubReMiner的话,可以自己先去百度一下这两件神器哈,都是有用到飞起,一秒超神的神器。

 但如果跟去年一样,GoPubMed停休半年多,那要怎么分析文献的趋势?还要怎么看应该投什么样的杂志呢?

 还要怎么样才能看到这样的杂志偏好性分析呢?

图片5.png

其实就用PubMed就可以实现了,但是在这之前,我们要装一个特别小的小软件,叫PubMed2XL:

image.png

当然,这不算是神器,就是个小工具,用起来也十分简单,就直接点击上面的Tools按钮就可以,先点击一下链接到PubMed的主页上哈:

image.png

进入主页,我们就随便搜个LncRNA看看LncRNA的研究进展哈,当然,我稍微筛选了一下,选择了2017年1月1日至今的文献,怪怪,也有3629篇了,足够分析了:

图片6.png

你可以看到文献右上角有个“Send to”的下拉菜单,点击进去,保存文件即可,记得不能保存TXT,要保存成XML文件,这个才是我们需要用的。接着在PubMed2XL的Tools里,点击导入这个下载的XML文件:

图片7.png

接着,就会自动生成一个Excel的文件,这个文件里,包含了包括标题、摘要,期刊名称/简称、PMID、期刊号、一作、通讯等等等等所有信息,而且都是带超链的……

图片8.png

于是我们就可以自由地对这些蚊帐进行具体分析了,比如,关于LncRNA发得最多的杂志是那个啊?

图片9.png

嗯,没错,最上面那个,350多篇的,就是OncoTarget……100多篇那个就是Scientific Reports…圆球的大小代表了IF的大小。要做出这个图,还需要关键的一步,嗯,对了,因为PubMed2XL所导出的Excel里,只有PubMed所提供原始数据,并没有IF,所以我们要再添加杂志的IF值进去,不过下次再说吧。你们回去先试试看自己做个简单的分析看看。回复“PubMedZXL”就给你这个软件的下载地址哈,很高兴地告诉大家,Mac可以用,但很难装……好吧,今天就先策到这里吧。